Amidaz (AMD)
Enzimler:Makromoleküler biyolojik katalizörlerdir, çoğu enzim proteindir.
Amidaz:Amidazlar, bir asil grubunu suya aktararak serbest asitler ve amonyak üretimiyle çeşitli endojen ve yabancı alifatik ve aromatik amidlerin hidrolizini katalize ederler. Hidroksamik asitler ve diğer organik asitler, büyüme faktörleri, antibiyotikler ve tümör inhibitörlerinin bileşenleri oldukları için yaygın olarak ilaç olarak kullanılırlar. Amidazlar, katalizör stereoselektivitesine göre R tipi ve S tipi asilazlar olarak ikiye ayrılabilir.
Amidaz, amidlerin hidrolizini katalize etmenin yanı sıra, hidroksilamin gibi yardımcı substratların varlığında açil transfer reaksiyonlarını da katalize edebilir.
Farklı kaynaklardan elde edilen amidazların farklı substrat özgüllükleri vardır; bazıları sadece aromatik amidleri, bazıları sadece alifatik amidleri, bazıları ise α- veya ω-amino amidleri hidrolize edebilir. Aminlerin çoğu sadece asiklik veya basit aromatik amidler için iyi katalitik aktivite gösterirken, kompleks aromatikler, heterosiklik amidler, özellikle orto sübstitüentli amidler için genellikle düşük aktiviteye sahiptir (sadece birkaç enzim daha iyi katalitik etki gösterir).
Katalitik mekanizma:
| Enzimler | Ürün Kodu | Ürün Kodu |
| Enzim Tozu | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 adet amidazdan oluşan bir set, her biri 50 mg (19 adet * 50 mg/adet) veya başka bir miktar. |
| Tarama Kiti (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 adet amidazdan oluşan bir set, her biri 1 mg (19 adet * 1 mg/adet) |
★ Yüksek substrat özgüllüğü.
★ Güçlü kiral seçicilik.
★ Yüksek dönüşüm verimliliği.
★ Daha az yan ürün.
★ Hafif reaksiyon koşulları.
★ Çevre dostu.
➢ Substrat özgüllüğü nedeniyle, enzim taraması belirli substratlar için yapılmalı ve hedef substratı en iyi katalitik etkiyle katalize eden bir enzim elde edilmelidir.
➢ Yüksek sıcaklık, yüksek/düşük pH ve yüksek konsantrasyonlu organik çözücüler gibi aşırı koşullarla asla temas ettirmeyin.
➢ Normalde, reaksiyon sistemi substrat, tampon çözelti (enzimin optimum reaksiyon pH'ı) içermelidir. Hidroksilamin gibi yardımcı substratlar, asil transfer reaksiyon sisteminde bulunmalıdır.
➢ AMD, optimum reaksiyon pH'ı ve sıcaklığıyla reaksiyon sistemine en son eklenmelidir.
➢ Tüm asit maden drenajı türlerinin farklı optimum reaksiyon koşulları vardır, bu nedenle her biri ayrı ayrı incelenmelidir.
Örnek 1(1):
Farklı Amid Substratlarına Karşı Hidroliz Aktivitesi
| Alt tabaka | Belirli aktivite μmol dakika-1mg-1 | Alt tabaka | Belirli aktivite μmol dakika-1mg-1 |
| Asetamid | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| Propionamid | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamit | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| Bütiramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0.8 |
| İzobütiramid | 26.2 | ο-Toluamid | 0.3 |
| Pentanamid | 22.0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Heksanamid | 6.4 | Nikotinamid | 1.7 |
| Sikloheksanamid | 19.5 | İzonikotinamid | 1.8 |
| Akrilamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrilamid | 3.5 | 3-Fenilpropionamid | 7.6 |
| Prolinamid | 3.4 | İndol-3-asetamid | 1.9 |
| Benzamid | 6.8 |
Reaksiyon, 70 ℃ sıcaklıkta, pH 7,5 olan 50 mM sodyum fosfat tampon çözeltisinde gerçekleştirildi.
| Amidler | Hidroksilamin | Hidrazin |
| Asetamid | 8.4 | 1.4 |
| Propionamid | 18.4 | 3.0 |
| İzobütiramid | 25.0 | 22.7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reaksiyon, 70 ℃ sıcaklıkta, pH 7,5 olan 50 mM sodyum fosfat tampon çözeltisinde gerçekleştirildi.
İlgili reaktif konsantrasyonları: amidler, 100 mM (benzamid, 10 mM); hidroksilamin ve hidrazin, 400 mM; enzim 0,9 μM.
Örnek 2(2):
Örnek 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., ve diğerleri. Ekstremofiller, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, ve diğerleri. Proses Biyokimyası, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM ve diğerleri. Biyoorganik Kimya, 2017, Çevrimiçi olarak mevcut 7.
