Amidaz (AMD)
enzimler:Makromoleküler biyolojik katalizörlerdir, çoğu enzim proteindir
Amidaz:Serbest asitler ve amonyak üretimi ile bir asil grubunu suya aktararak çeşitli endojen ve yabancı alifatik ve aromatik amidlerin hidrolizini katalize eder.Hidroksamik asitler ve diğer organik asitler, büyüme faktörlerinin, antibiyotiklerin ve tümör inhibitörlerinin bileşenleri oldukları için yaygın olarak ilaç olarak kullanılmaktadır.Amidazlar, katalizör stereoselektivitesine göre R tipi ve S tipi asilazlara bölünebilir.
Amitlerin hidrolizini katalize etmenin yanı sıra, amidaz, hidroksilamin gibi ortak substratların varlığında asil transfer reaksiyonlarını da katalize edebilir.
Farklı kaynaklara sahip amidazların farklı substrat özgüllükleri vardır, bazıları sadece aromatik amidleri hidrolize edebilir, bazıları sadece alifatik amidleri hidrolize edebilir ve bazıları α- veya ω-amino amidleri hidrolize edebilir.Aminlerin çoğu sadece asiklik veya basit aromatik amidler için iyi katalitik aktiviteye sahiptir, ancak kompleks aromatikler için heterosiklik amidler, özellikle orto ikameli amidler genellikle düşük aktiviteye sahiptir (sadece birkaç enzim daha iyi katalitik etkiler gösterir).
Katalitik mekanizma:
| enzimler | Ürün Kodu | Ürün Kodu |
| enzim tozu | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 amidazdan oluşan bir set, her biri 50 mg 19 madde * 50 mg / madde veya başka bir miktar |
| Tarama Kiti (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 amidazdan oluşan bir set, her biri 1 mg 19 madde * 1 mg / madde |
★ Yüksek substrat özgüllüğü.
★ Güçlü kiral seçicilik.
★ Yüksek dönüşüm verimliliği.
★ Daha az yan ürün.
★ Hafif reaksiyon koşulları.
★ Çevre dostu.
➢ Substrat spesifikliği nedeniyle spesifik substratlar için enzim taraması yapılmalı ve hedef substratı en iyi katalitik etki ile katalize eden bir enzim elde edilmelidir.
➢ Yüksek sıcaklık, yüksek/düşük pH ve yüksek konsantrasyonlu organik solvent gibi aşırı koşullarla asla temas ettirmeyin.
➢ Normal olarak, reaksiyon sistemi substratı, tampon solüsyonu (enzimin optimum reaksiyon pH'ı) içermelidir.Asil transfer reaksiyon sisteminde hidroksilamin gibi yardımcı substratlar bulunmalıdır.
➢ AMD, optimum reaksiyon pH ve sıcaklığında reaksiyon sistemine en son eklenmelidir.
➢ Her tür AMD'nin çeşitli optimum reaksiyon koşulları vardır, bu nedenle her biri ayrı ayrı incelenmelidir.
örnek 1(1):
Farklı Amid Substratlarına hidroliz aktivitesi
| substrat | Spesifik aktivite μmol dk-1mg-1 | substrat | Spesifik aktivite μmol dk-1mg-1 |
| Asetamit | 3.8 | ο-OH benzamid | 1.4 |
| propionamid | 3.9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| laktamit | 12.8 | ο-NH2benzamid | 1.0 |
| bütiramid | 11.9 | p-NH2benzamid | 0,8 |
| izobütiramid | 26.2 | ο-toluamid | 0,3 |
| Pentanamid | 22.0 | p-toluamid | 8.1 |
| heksanamid | 6.4 | nikotinamid | 1.7 |
| sikloheksanamid | 19.5 | izonikotinamid | 1.8 |
| akrilamid | 10.2 | pikolinamid | 2.1 |
| metakrilamit | 3.5 | 3-fenilpropionamid | 7.6 |
| prolinamid | 3.4 | indol-3-asetamid | 1.9 |
| Benzamid | 6.8 |
Reaksiyon, 70°C'de pH 7.5 olan 50 mM sodyum fosfat tampon çözeltisi içinde gerçekleştirildi.
| amidler | hidroksilamin | hidrazin |
| Asetamit | 8.4 | 1.4 |
| propionamid | 18.4 | 3.0 |
| izobütiramid | 25.0 | 22,7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reaksiyon, 70°C'de pH 7.5 olan 50 mM sodyum fosfat tampon çözeltisi içinde gerçekleştirildi.
İlgili reaktif konsantrasyonu: amidler, 100 mM(benzamid, 10 mM);hidroksilamin ve hidrazin, 400 mM;enzim 0.9 uM.
Örnek 2(2):
Örnek 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., et al.Ekstremofiller, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR, et al.Proses Biyokimyası, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM, et al.Bioorganic Chemistry, 2017, Çevrimiçi olarak erişilebilir 7.
